More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0870 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 207 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 230 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 437 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>