265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1372 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.24 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  46.67 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  28.82 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.88 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  35 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.18 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>