197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 211 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 207 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  40.58 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0674  blue (type 1) copper domain protein  32.46 
 
 		 534 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  43.24 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0718  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.855562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 193 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 770 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 225 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 196 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  29.41 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>