175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12279 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 279 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  40.22 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  39.69 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 212 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  25.17 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  40.38 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  34.15 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  27.07 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  30.1 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 388 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  39.24 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  27.63 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  24.83 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>