117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2703 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  100 
 
 		 182 aa  357  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 259 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 317 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 245 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 330 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 226 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.79 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  37.88 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.41 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 191 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 212 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 219 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 233 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 187 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 225 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 233 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.85 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>