175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1711 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  94.06 
 
 		 219 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1999  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.897874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2933  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  38.67 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  26.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  34.12 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>