More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2515 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  62.9 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  43.36 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  40.43 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 205 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  32.72 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  42.7 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.59 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.59 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  49.21 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  50 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  44.12 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  46.55 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  52.83 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  48.21 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  44 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  44.83 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>