More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7073 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  32.4 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.56 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  28.86 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  28.69 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  28.93 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 390 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>