More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0930 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  61.05 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  48.13 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  53.25 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.99 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.89 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  21.99 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.14 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20170  hypothetical protein  40.48 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0847124  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  21.76 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.44 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 98 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 248 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  29.2 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  48.94 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  48.94 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  38.27 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>