More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20170  hypothetical protein  95.37 
 
 		 108 aa  217  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0847124  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  23.46 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  26.54 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  23.91 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.83 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  24.2 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 319 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.52 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>