More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3060 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  89.66 
 
 		 215 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 307 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 333 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.41 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  26.01 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.13 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  23.83 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  25.41 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.32 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  25.29 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>