More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1062 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  23 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 287 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.22 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.64 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.49 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>