More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3091 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 257 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 203 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.99 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  28.85 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.72 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.59 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>