More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3198 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  34.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  30.11 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  38.2 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  42.05 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>