More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0670 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 98 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.82 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.83 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  42.37 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>