More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3329 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  43.1 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.13 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  24.8 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  31.46 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  18.91 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  41.82 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  32 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  40 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
198 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
227 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
197 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
209 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
238 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
204 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
207 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
211 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
235 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
210 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
271 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
188 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>