More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1745 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
207 aa  99  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
291 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  43.37 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 
310 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  61.7 
 
 
332 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 
181 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 
218 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  42.68 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  25.93 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
200 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.92 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
196 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
200 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
269 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.98 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  49.21 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  47.46 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  39.13 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>