More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2666 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.95 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  26.97 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>