More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1493 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  40.79 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.54 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>