More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2437 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.65 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.19 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  30.2 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>