More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0269 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 207 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 770 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  28.26 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.76 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>