More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05020 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 324 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 770 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  31.17 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  25.86 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.08 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>