More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2592 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  20.24 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40.58 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  35.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>