More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0191 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  31.78 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5139  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  24.86 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
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