More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1837 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  48.76 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  36 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.92 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>