More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3293 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.22 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.06 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  34.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 423 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  38.81 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  41.94 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.47 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  28.87 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>