More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23280 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  23.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.47 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  23.41 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 398 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>