More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3296 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  37.17 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.46 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  43.04 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
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NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  44.44 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  28.93 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
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NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  29.93 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
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NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
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NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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