More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6471 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.02 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  49.12 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  35.53 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  30.36 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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