More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0260 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 219 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 219 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 204 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  32.95 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  50.85 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  28.4 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  25.85 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  45.07 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.85 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 184 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 185 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>