275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1746 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  26 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.17 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  24.04 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  45.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>