More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4073 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 239 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.65 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.65 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.82 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  28.71 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  26.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  33.61 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  28.86 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.25 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  58.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  34.44 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>