178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2069 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  69.09 
 
 		 223 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.37 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.7 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.7 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.7 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  30.56 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  26.47 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  30 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  38.36 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  42 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>