More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0992 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 198 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  32.79 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  26.9 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  25.32 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 385 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 414 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>