More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3524 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  45.98 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  31.31 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  37.97 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  37.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 87 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31.85 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 307 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  33.64 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>