180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0854 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.55 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.75 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.75 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 225 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  55.05 
 
 		 232 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.97 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.97 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 277 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  32.43 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.25 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.28 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.3 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  29.3 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  26.47 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 246 aa  45.1  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  41.18 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>