More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3200 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  48.68 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 224 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  36.68 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 202 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  41.76 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  45.31 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.84 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.42 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.71 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  38.38 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.71 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.67 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.88 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>