100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3548 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  50.92 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51.42 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  47.74 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  47.62 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  41.72 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.38 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 403 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  38.71 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  45.76 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 208 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 201 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 219 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 200 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 235 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 243 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  34.69 
 
 		 226 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  29.81 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>