More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3352 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  99.17 
 
 
241 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  99.49 
 
 
197 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  98.98 
 
 
197 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  93.2 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  95.43 
 
 
197 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  95.43 
 
 
197 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  94.92 
 
 
197 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  94.42 
 
 
197 aa  381  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
191 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
195 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.45 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  24.5 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
201 aa  61.6  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.04 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  39.68 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
245 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
291 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  21.72 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  28.03 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  44.44 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  24 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 
194 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
238 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
217 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 
204 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
204 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
194 aa  52  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
212 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
198 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
208 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
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NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
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