More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2967 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  81.68 
 
 		 211 aa  337  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  37.58 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.67 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  47.46 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  45.61 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  39.06 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>