More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4464 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
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NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  86.33 
 
 		 277 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  74.82 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  74.46 
 
 		 275 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
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NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.11 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.56 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 223 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.86 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.76 
 
 		 226 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
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NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 220 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  28.34 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  43.33 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  39.77 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
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NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
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