More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  51.31 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  51.01 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 193 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  37.91 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  37.06 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  33.51 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  36.76 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  33.65 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  30.18 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.7 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  31.07 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>