More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0855 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  72  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  25.97 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.71 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  30 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  47.69 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  31.97 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.32 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  30.82 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 317 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>