297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5005 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  31.44 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  36.6 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  33.5 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 189 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 203 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1421  hypothetical protein  48.72 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.39 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  33.07 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.31 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  39.24 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>