More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5607 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  30.91 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  34.64 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  40.51 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  30.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>