More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8733 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  48.88 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  32.8 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  41.11 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.23 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  36.56 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>