More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0184 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  396  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  31.11 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  34.38 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  24 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.5 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  30.91 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  21.97 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  35.44 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.51 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  31.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 290 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.19 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>