167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3541 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  43.28 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  42.59 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  51.16 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  25.35 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  42.19 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  35.21 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>