133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1159 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 227 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  27.52 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.89 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  32.39 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  40.38 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>