94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1262 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.15 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  30.48 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.1 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  34.38 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 246 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 245 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 199 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 258 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 187 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>